#!/bin/bash
#SBATCH -t 2:00:00
#SBATCH --nodes=1 --ntasks-per-node=1
#SBATCH --export=NONE
#SBATCH --mem=24g

module load prokka/1.11-foss-2016b-BioPerl-1.7.0

prokka --setupdb
prokka ./assembly.fasta --outdir prokka_annotation --prefix hpara
